如何在 R 中安装 limma - Shell-Bash

Limma是一个在R中广泛使用的生物信息学软件包，用于常规和微阵列数据的分析和可视化。在这篇文章中，我们将向您介绍如何在R中安装limma软件包。

前提条件

• 安装R编程语言
• 具有管理员权限的终端窗口（Windows用户需要以管理员身份运行cmd）

步骤

在R中安装limma软件包有两种方法：从CRAN仓库安装和从Bioconductor安装。下面我们将介绍这两种方法的步骤。

从CRAN仓库安装

1. 打开R编程语言，并执行以下命令：

install.packages("limma")

2. 安装过程可能需要一些时间，请耐心等待。安装完成后，您可以加载软件包并检查版本号：

library(limma)
packageVersion("limma")

从Bioconductor安装

1. 在R中执行以下命令以安装BiocManager软件包：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

2. 安装过程可能需要一些时间，请耐心等待。安装完成后，您可以使用BiocManager安装limma软件包：

BiocManager::install("limma")

3. 安装完成后，您可以加载软件包并检查版本号：

library(limma)
packageVersion("limma")

结论

现在您已经学会了如何在R中安装limma软件包。通过安装limma，您可以分析和可视化常规和微阵列数据。此外，您还可以从官方网站https://bioconductor.org/packages/release/bioc/查找其它有趣的生物信息学软件包，以拓展你的生物信息学分析技能。