安装 netcdf4 - Shell/Bash

NetCDF (Network Common Data Form) 是一种数据格式，用于多维科学数据的存储和交换。 NetCDF 4 通过支持压缩、分块存储和并行 I/O 等功能，提高了数据的可用性和效率。

这里介绍在 Shell/Bash 环境下安装 netcdf4。

前置条件

• 确保已经安装了必要的 build 工具。

安装

1. 下载源代码：

   wget ftp://ftp.unidata.ucar.edu/pub/netcdf/netcdf-4.7.4.tar.gz
   

2. 解压源代码包：

   tar -xzf netcdf-4.7.4.tar.gz
   

3. 进入源代码目录：

   cd netcdf-4.7.4
   

4. 编译和安装：

   ./configure --prefix=/usr/local/netcdf4 --disable-dap
   make
   sudo make install
   

   解释：

   • --prefix：指定安装的目录。
   • --disable-dap：禁用 DAP (Distributed Access Protocol) 功能，因为它需要一些额外的依赖项。

5. 最后，将以下语句添加到您的 .bashrc 文件或运行它，使系统能够找到 netCDF 库：

   export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/netcdf4/lib:$LD_LIBRARY_PATH
   

   如果您使用的是 zsh shell，你需要将语句添加到 .zshrc 文件。

测试

您可以尝试编译一个简单的程序，测试安装是否成功。

例如，创建一个名为 test_nc.c 的文件，并将以下代码放入文件中：

#include <stdio.h>
#include <netcdf.h>

#define FILE_NAME "test.nc"
#define DIM_LEN 4

int main() {
    int res, ncid, dimid, varid;
    int dimids[] = {0};
    float data[DIM_LEN] = {1.0, 2.0, 3.0, 4.0};

    /* create empty NetCDF file */
    res = nc_create(FILE_NAME, NC_CLOBBER, &ncid);
    if (res != NC_NOERR) goto done;

    /* define a dimension */
    res = nc_def_dim(ncid, "time", DIM_LEN, &dimid);
    if (res != NC_NOERR) goto done;

    /* define a variable */
    res = nc_def_var(ncid, "data", NC_FLOAT, 1, dimids, &varid);
    if (res != NC_NOERR) goto done;

    /* write data to variable */
    res = nc_put_var(ncid, varid, data);
    if (res != NC_NOERR) goto done;

    /* close NetCDF file */
    nc_close(ncid);

done:
    if (res != NC_NOERR) printf("Error: %s\n", nc_strerror(res));
    return res;
}

然后使用以下命令编译程序：

gcc -o test_nc test_nc.c -lnetcdf

如果编译成功，运行程序并创建名为 test.nc 的文件：

./test_nc

执行完后，在当前目录下会生成一个名为 test.nc 的文件。

结论

以上是在 Shell/Bash 环境下安装 netcdf4 的步骤，通过测试程序的执行结果，验证了安装的成功性。