在 Java 中执行多行 shell 命令可以通过 Runtime 类的 exec() 方法实现。该方法使用字符串数组作为参数，每个字符串代表一个单独的命令和它的参数列表。相应地，使用分号分隔这些命令可以实现执行多行 shell 命令。

下面给出一个简单的示例代码，展示如何在 Java 中执行多行 shell 命令：

import java.io.IOException;

public class ShellCommand {
    public static void main(String[] args) {
        try {
            // 多行 shell 命令
            String[] commands = {"echo 'Hello World';",
                                 "ls -a;",
                                 "cd /; pwd;"};
            // 获取 Runtime 实例
            Runtime runtime = Runtime.getRuntime();
            // 执行命令
            Process process = runtime.exec(commands);
            // 等待命令执行完成
            process.waitFor();
            // 输出命令执行结果
            System.out.println(new String(process.getOutputStream().readAllBytes()));
        } catch (IOException | InterruptedException e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }
}

上述代码定义了一个字符串数组，其中包含三个字符串，分别代表三个 shell 命令和它们的参数。然后，Runtime 类的 exec() 方法被调用，将该字符串数组作为参数传递给它执行。最后，我们等待命令执行完成并输出命令执行结果。

在执行多行 shell 命令时，需要注意每个命令之间使用分号 ; 进行分隔。同时，为了避免命令执行失败的情况，我们需要在程序中添加异常处理代码。

综上，我们可以通过 Runtime 类的 exec() 方法在 Java 中执行多行 shell 命令，只需要将这些命令按照顺序放在一个字符串数组中，然后使用分号分隔即可。