如何从终端打开带有原子的文件

有时候我们需要在终端中打开带有原子的文件，比如常见的 .pdb 文件。在这篇文章中，我们会探讨在不同操作系统下如何打开带有原子的文件，并给出相应的代码示例。

在 Linux 下打开 .pdb 文件

在 Linux 中，我们可以使用 VMD （Visual Molecular Dynamics）来打开 .pdb 文件。VMD 是一款可以使用交互式 3D 图形可视化工具，在 Linux 下我们可以使用以下命令来安装：

sudo apt-get update
sudo apt-get install vmd

在安装完成 VMD 后，我们可以通过以下命令来运行 VMD 并打开 .pdb 文件：

vmd filename.pdb

在 macOS 下打开 .pdb 文件

在 macOS 中，我们可以使用 Chimera 来打开 .pdb 文件。Chimera 是一款由美国加利福尼亚大学、San Francisco 分校研制、并由美国国立卫生研究院援助支持的分子模拟和分析软件，在 macOS 下我们可以使用以下命令来安装：

brew cask install chimera

在安装完成 Chimera 后，我们可以通过以下命令来运行 Chimera 并打开 .pdb 文件：

chimera filename.pdb

在 Windows 下打开 .pdb 文件

在 Windows 中，我们可以使用 VMD（Visual Molecular Dynamics）或者 Discovery Studio 来打开 .pdb 文件。

使用 VMD：

在 Windows 下，我们可以使用以下命令来安装 VMD：

choco install vmd

在安装完成 VMD 后，我们可以通过以下命令来打开 .pdb 文件：

vmd.exe filename.pdb

使用 Discovery Studio：

Discovery Studio 是由生物科技公司 Accelrys 研发的一款分子模拟和分析软件，在 Windows 下我们可以使用以下命令来安装：

下载 Discovery Studio 并安装后，在界面中选择 File -> Open（或按快捷键 Ctrl + O）即可打开 .pdb 文件。

结论

本文介绍了在 Linux、macOS、Windows 下如何打开带有原子的文件。当然，在不同操作系统下的安装方法可能有所不同，但是我们可以通过一些工具来实现对原子文件的查看。