Bash 将 chr 添加到 vcf 的开头

在 Bash shell 中，可以使用以下脚本将 "chr" 添加到 VCF 文件的每一行开头。

#!/bin/bash

input_file="input.vcf"
output_file="output.vcf"

# 添加 chr 到每一行的开头
sed 's/^/chr/' "$input_file" > "$output_file"

echo "成功将 chr 添加到 VCF 文件的开头！"
echo "生成的文件名为 $output_file"

通过上述脚本，可以实现将 VCF 文件中每一行的开头添加 "chr" 前缀。脚本中使用了 sed 命令，它用于对文本进行替换操作。

将以上代码保存为 add_chr_to_vcf.sh 文件，并为其分配可执行权限。然后，可以通过运行以下命令来执行脚本：

./add_chr_to_vcf.sh

脚本会读取 input.vcf 文件，并将修改后的内容保存到 output.vcf 文件中。成功执行后，会在终端上显示相应的提示信息。

请确保将上述脚本中的 input.vcf 替换为实际的 VCF 文件名，并将 output.vcf 替换为生成的结果文件名。

希望上述介绍对你有帮助，在操作时请谨慎。