📜  切片编号 dicom 标记 (1)

📅  最后修改于: 2023-12-03 15:36:51.078000             🧑  作者: Mango

切片编号 DICOM 标记

介绍

在 DICOM 标准中,切片编号标记是用于标识医学影像数据集中每个图像的唯一标识符。对于三维医学影像数据集,这些标记用于识别在图像体积中的位置,因此它们在医学成像中是非常重要的。

在 DICOM 中,切片编号标记包含在某些数据组(如图像位置和方向)中,可用于计算切片之间的间隔,并确定切片在 3D 几何空间中的位置。

DICOM 切片编号示例

DICOM 中的切片编号被命名为 Slice Location 标记,并且可以在数据集的元数据中找到。例如,下面是一个 DICOM 数据集的一部分,其 Slice Location 标记设置为 -31.5000:

(0020,0013) DS [0.0]                                      #   2, 1 ImageNumber
(0020,0032) DS [-125.000000\0.000000\-31.500000]          #  24, 3 ImagePositionPatient
(0020,1041) DS [25.000000]                                 #   8, 1 SliceLocation

在这里,我们可以看到 Slice Location 标记的值为 25.0,这是医学成像中每个切片的标识符。

Python 使用 DICOM 切片编号

Python 拥有许多强大的库,可以使 DICOM 影像数据解析和分析变得十分简单。使用 Pydicom 库,可以轻松地获取 DICOM 数据集中的 Slice Location 标记。

例如,以下代码段演示了如何使用 Pydicom 库获取 DICOM 影像数据集中每个切片的 Slice Location 标记:

import pydicom

# 定义 DICOM 格式数据集路劲
path_to_dicom_file = "/path/to/dicom/file.dcm"

# 加载 DICOM 数据集
ds = pydicom.dcmread(path_to_dicom_file)

# 获取每个切片的 Slice Location 标记
for i in range(ds.NumberOfFrames):
    slice_location = ds.PerFrameFunctionalGroupsSequence[i].PlanePositionSequence[0].ImagePositionPatient[2]
    print(f"Slice {i+1} has a Slice Location of {slice_location}")

在此代码片段中,我们只需指定 DICOM 数据集的路径即可使用 Pydicom 库加载该数据集。然后,通过在数据集中循环检查每个切片的 Slice Location 标记来获取每个切片的位置。最后,我们使用输出语句打印出每个切片的 Slice Location 值。

结论

在 DICOM 中,切片编号标记是医学影像数据集中每个图像的唯一标识符。它们是医学成像中重要的元数据,用于计算切片之间的间隔,并确定切片在 3D 几何空间中的位置。Python 中的 Pydicom 库很容易地允许程序员使用 DICOM 数据集中的 Slice Location 标记进行编程分析和处理。