📅  最后修改于: 2023-12-03 15:10:03.068000             🧑  作者: Mango
DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)是一种用于医疗影像的标准格式,主要用于医学图像和数据的传输、存储、打印等。在 Python 中,我们可以使用 Pydicom 库来读取和操作 DICOM 文件。
使用 Pydicom 之前需要先安装。可以使用 pip 命令进行安装:
pip install pydicom
使用 Pydicom 读取 DICOM 文件非常简单。假设我们有一个名为 image.dcm
的 DICOM 文件,可以使用以下命令将该文件读取为 Dataset
对象:
import pydicom
ds = pydicom.dcmread('image.dcm')
这里的 ds
就是我们读取到的 DICOM 文件。
使用 Dataset
对象的属性可以查看 DICOM 文件的各种信息,例如像素大小、图像位置、患者信息、扫描参数等等。以下是一些常用的属性:
ds.pixel_array
:图像的像素矩阵,可以作为 numpy 数组使用。ds.pixel_spacing
:像素间距。ds.ImagePositionPatient
:影像位置。ds.PatientName
:患者姓名。ds.Modality
:影像类型(CT、MR、X-ray 等)。例如,我们可以使用以下代码获取图像的像素矩阵:
import matplotlib.pyplot as plt
plt.imshow(ds.pixel_array, cmap=plt.cm.gray)
plt.show()
Pydicom 还允许我们修改 DICOM 文件的属性,例如修改像素矩阵、像素间距等。以下是一些常用的修改方法:
ds.PixelData = new_pixel_array.tobytes() # 修改像素矩阵
ds.PixelSpacing = [dx, dy] # 修改像素间距
最后,我们可以使用以下命令将修改后的 Dataset
对象保存为 DICOM 文件:
ds.save_as('new_image.dcm')
这里的 new_image.dcm
就是我们保存的新文件名。
以上就是使用 Python 打开 DICOM 图像的简单介绍。如果你需要对 DICOM 文件进行更加深入的操作,建议先阅读一下 Pydicom 的文档。