📜  Biopython-安装

📅  最后修改于: 2020-11-09 04:57:03             🧑  作者: Mango


本节说明如何在您的计算机上安装Biopython。它非常容易安装,并且不会超过五分钟。

第1步-验证Python安装

Biopython旨在与Python 2.5或更高版本一起使用。因此,必须首先安装Python 。在命令提示符中运行以下命令-

> python --version

它定义如下-

验证Python安装

如果安装正确,它将显示Python的版本。否则,请下载最新版本的Python,进行安装,然后再次运行命令。

第2步-使用pip安装Biopython

在所有平台上,都可以从命令行使用pip安装Biopython。键入以下命令-

> pip install biopython

屏幕上将显示以下响应-

使用pip安装Biopython

对于更新旧版本的Biopython-

> pip install biopython –-upgrade

屏幕上将显示以下响应-

更新旧版本

执行此命令后,在安装最新版本之前,将删除旧版本的Biopython和NumPy(取决于Biopython)。

步骤3-验证Biopython安装

现在,您已经在计算机上成功安装了Biopython。要验证Biopython是否已正确安装,请在Python控制台上键入以下命令-

验证Biopython安装

它显示了Biopython的版本。

备用方式-使用Source安装Biopython

要使用源代码安装Biopython,请按照以下说明进行操作-

-从以下地址下载最新Biopython释放https://biopython.org/wiki/Download

到目前为止,最新版本是biopython-1.72

下载文件并解压缩压缩的存档文件,移至源代码文件夹并键入以下命令-

> python setup.py build

这将从下面给出的源代码构建Biopython-

使用Source安装Biopython

现在,使用以下命令测试代码-

> python setup.py test

测试代码

最后,使用以下命令进行安装-

> python setup.py install

最终安装