使用 ggboxplot 和 ggpubr 更改顺序

介绍

R 语言中有很多用于绘制箱线图（Box plot）的函数，其中 ggboxplot() 是使用 Ggplot2 绘制箱线图的万能函数。但是，在对于数据分析过程中，我们可能需要对定义好的顺序进行一些更改，这时我们就需要使用 ggpubr 包。

本文将介绍如何使用 ggboxplot() 和 ggpubr 更改顺序，以便您能更好的在 R 语言中进行数据分析。

准备工作

在使用 ggpubr 包前，我们需要先安装和加载该包。

install.packages("ggpubr")
library(ggpubr)

我们还需要准备一个数据集以展示如何进行操作。

data("ToothGrowth")

下面是数据集的简要说明：

• len：牙齿长度
• supp：维生素增强的供给方式
• dose：剂量

接下来，我们将展示如何使用 ggboxplot() 和 ggpubr 绘制箱线图并更改顺序。

ggboxplot 函数

使用 ggboxplot() 绘制箱线图时，我们可以使用 x 和 y 参数来指定 x 轴和 y 轴的列。

ggboxplot(data = ToothGrowth, x = "supp", y = "len")

更改顺序

方法一

我们可以使用 reorder() 函数，该函数会根据我们指定的列重新排序数据集。

ToothGrowth$supp <- reorder(ToothGrowth$supp, ToothGrowth$len, median)
ggboxplot(data = ToothGrowth, x = "supp", y = "len")

这里我们使用 median 参数来指定用中位数来排序，结果如下：

此时，箱线图中的维生素 C 对应的中位数更大，比其它部分更为突出。

方法二

ggpubr 包提供了一个更加方便的函数 reorder_within()，可以在类别内部对箱线图重新排序。我们首先需要对数据框进行设置以指定类别和子类别。

ToothGrowth$supp <- as.factor(ToothGrowth$supp)
ToothGrowth$dose <- as.factor(ToothGrowth$dose)

接着，我们使用 ggboxplot() 函数绘制箱线图，并使用 reorder_within() 函数更改维生素 C 和维生素 O 的顺序。

ggboxplot(data = ToothGrowth, x = "supp", y = "len", color = "dose") + 
  scale_color_brewer(palette = "RdYlBu") + 
  xlab("Supplement Type") + 
  ylab("Tooth Length") + 
  reorder_within("supp", "len", ToothGrowth, median)

结果如下：

可以看到，reorder_within() 函数更加方便，因为它可以在类别内部进行重新排序。

结论

使用 ggboxplot() 和 ggpubr 可以方便的绘制箱线图，并更改顺序。在使用 ggpubr 包时，只需要使用 reorder_within() 函数即可。