在 R 编程中创建热图 – heatmap()函数

R 语言中的heatmap()函数用于绘制热图。热图被定义为使用颜色来可视化矩阵值的数据的图形表示。在这种情况下，为了表示更常见的值或更高的活性，基本上使用较亮的颜色，而对于不太常见或活性值，较暗的颜色是首选。热图也由着色矩阵的名称定义。

R - 热图（）函数

Syntax: heatmap(data)

Parameters: 

• data: It represent matrix data, such as values of rows and columns

Return: This function draws a heatmap. 

示例 1：在 R 编程语言中创建热图

r

# Set seed for reproducibility
set.seed(110)
 
# Create example data
data <- matrix(rnorm(100, 0, 5), nrow = 10, ncol = 10)
 
# Column names
colnames(data) <- paste0("col", 1:10)
rownames(data) <- paste0("row", 1:10)
 
# Draw a heatmap
heatmap(data)

输出：

在这里，在上面的示例中，指定了行数和列数以使用给定函数绘制热图。

示例 2：在热图中使用 colorRampPalette

r

# Set seed for reproducibility
set.seed(110)
 
# Create example data       
data <- matrix(rnorm(100, 0, 5), nrow = 10, ncol = 10)
 
# Column names   
colnames(data) <- paste0("col", 1:10)
rownames(data) <- paste0("row", 1:10)
 
# Remove dendogram
# Manual color range
my_colors <- colorRampPalette(c("cyan", "darkgreen"))
 
# Heatmap with manual colors
heatmap(data, col = my_colors(100))                           

输出：

在上面的示例中，热图是通过使用 colorRampPalette 合并两种不同的颜色来绘制的。